99.99% - это клон чтоли?
Обычно у детей два родителя и от каждого ровно по половине хромосом.
А если учитывать, что Y-хромосома(та что от отца) меньше чем X-хромосома(та что от матери), а так же принять во внимание митохондриальную ДНК(которая передается только от матери), то у сына чуть менее 50% отцовской ДНК.